Вернувшись в свой разрушенный семейный дом, Атсу начинает охоту на оставшеюся Шестерку Йотей. Она узнает, что Сайто собирает повстанческую армию, чтобы захватить весь остров Эдзо в качестве самозваного "сегуна Севера". Клан Мацумаэ, лояльный сегуну, объявил войну Сайто. Атсу путешествует по Йотею, убивая силы Сайто, помогая местным жителям и тренируясь у различных мастеров оружия. По мере того, как репутация Атсу растет, у нее появляются последователи, которых называют "Волчьей стаей".
Научившись владеть катаной у Ханбея, бывшего лучшего охотника за головами Эдзо и старого друга ее отца, Атсу пытается убить Сайто в его тренировочном лагере, но терпит неудачу. Удивленный тем, что она жива, он вызывает ее на дуэль, которая прерывается, когда Мацумаэ нападают на крепость. Ханбею удается спасти ее и он призывает прекратить вендетту, в то время как Сайто скрывается.
Преследуя Они на равнине Исикари, Атсу обнаруживает, что ее брат Дзюбэй также пережил резню и был спасен кланом Мацумаэ, повысившись в звании и став самурайским офицером Китамори. Атсу и Дзюбэй проникают в крепость Они, замок Исикари, чтобы убить его, но их попытка оказывается неудачной, и они вдвоем убегают. Дзюбэй изо всех сил пытается примирить свою любовь к сестре с чувством долга перед Мацумаэ в сочетании с ее самоубийственным безрассудством и пренебрежением к жизням пленных, захваченных Они, и в отчаянии оставляет ее, прежде чем вернуться к своим людям. Атсу направляется в лагерь Мацумаэ, чтобы получить информацию от бывшего налетчика Они по имени Безумный Горо, но силы Они прибывают и убивают самураев. Брат и сестра примиряются и узнают о тайном ходе в замок. Они проникают внутрь, подстрекают заключенных к бунту и вместе убивают Они, а Атсу помогает сжечь замок дотла.
После того, как Атсу чудом выжила в засаде на хребте Тесио, она помогает странствующей исполнительнице сямисэн Оюки выследить Кицунэ и помешать ему изготовить волчий яд в его крепости. Когда Кицунэ не узнает ее, Атсу приходит к выводу, что Оюки была настоящей Кицунэ. Оюки признает, что раньше она была Кицунэ, служившей шиноби Сайто, которая спасла Атсу и позволила ей сбежать после того, как Сайто повесил мать Атсу. Разочарованная Ночью горящего дерева, Оюки планировала предать его, но сама была предана и заменена на Кицунэ своим учеником Додзюном, а Сайто заклеймил ее в наказание. После дуэли Атсу прощает Оюки, которая обучает ее приемам шиноби, дает ей противоядие от токсина Доджуна и помогает ей убить его.
Когда Атсу и Дзюбэй воссоединяются дома, Дзюбэй встречает Оюки и чуть не нападает на нее в гневе, когда она раскрывает, что она Кицунэ, прежде чем она сообщает, что Сайто и его сыновья, Дракон и Паук, планируют напасть на сердце Мацумаэ. Прорвавшись через вражеские позиции, Дзюбэй спасает от казни юную девушку и узнает, что это его дочь Кику. Пока Дзюбэй увозит ее в безопасное место, в замок Мацумаэ, Атсу и Оюки ищут сыновей Сайто. Поскольку Дракон оказался слишком осторожным после того, как Атсу и Дзюбэй попытались убить его на маяке, Атсу захватила в плен его младшего брата, Паука, когда он разыгрывал Ночь горящего дерева как игру. Разъяренная, Атсу уничтожила силы Сайто, но остановилась на убийстве Паука, и Оюки взяла его в плен и переправила в замок Мацумаэ. Мацумаэ организуют его публичную казнь, чтобы выманить Дракона, при этом Паук упоминает о могильниках своего клана в районе Токачи, но в это время их перехитрила контратака Сайто на замок и отвлекли его корабли. Дзюбэй и Оюки отправляются защищать замок и спасать Кику, умоляя Атсу помочь, но та остается, чтобы убить Дракона. Когда замок рушиться, Дзюбэй и Оюки пропадают без вести, несмотря на то, что Атсу сражается с людьми Сайто, чтобы добраться до них. Пробившись сквозь толпу самураев, чтобы спастись, Паук забирает тело Дракона, но Сайто в отчаянии отрекается от него в наказание за то, что тот позволил его брату умереть.
Найдя Кику в безопасности в соседнем храме, Атсу эвакуирует ее в дом своей семьи. Кику начинает точно так же становится одержимой местью и критикует Атсу за то, что она бросила Дзюбея и Оюки. На кладбище клана Сайто Атсу выслеживает Паука, который рассказывает, что Дзюбей и Оюки были захвачены Сайто в плен, и рассказывает ей, что он потерял свою маленькую сестру после того, как отец Атсу предал Сайто. После поединка, в результате которого Атсу щадит Паука, он предлагает отвести ее в замок своего отца, прежде чем покинуть Эдзо и отправиться на материк. Атсу спасает Дзюбэя и Оюки и узнает, что Сайто ждет ее в доме ее семьи, взяв Кику в заложники. Атсу и Дзюбэй сражаются с Сайто, и Дзюбэй получает смертельную рану. Атсу удается обезоружить Сайто и пригвоздить к ее фамильному древу обоими мечами, и когда Сайто умоляет убить его, она оставляет того истекать кровью. Прежде чем Дзюбей умирает от ран, Атсу обещает ему, что позаботится о Кику. Атсу обнимает Кику, и они вместе оплакивают смерть Дзюбэя. Наконец обретя успокоение и смысл жизни вместо мести, она оставляет роль онрё, чтобы жить тихой, мирной жизнью в качестве опекуна Кику.